MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_011988	TG	3	6	1236880	1236885	0 %	50 %	50 %	0 %	222107141
21502	NC_011988	ATT	2	6	1236902	1236907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107141
21503	NC_011988	CCG	2	6	1236908	1236913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107141
21504	NC_011988	CTG	2	6	1236963	1236968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107141
21505	NC_011988	TCC	2	6	1236988	1236993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107141
21506	NC_011988	CCA	2	6	1237008	1237013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107141
21507	NC_011988	CCA	2	6	1237080	1237085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107141
21508	NC_011988	AG	3	6	1237117	1237122	50 %	0 %	50 %	0 %	222107141
21509	NC_011988	AT	3	6	1237164	1237169	50 %	50 %	0 %	0 %	222107141
21510	NC_011988	CCT	2	6	1237239	1237244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107141
21511	NC_011988	GCT	2	6	1237245	1237250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107141
21512	NC_011988	GGCG	2	8	1237251	1237258	0 %	0 %	75 %	25 %	222107141
21513	NC_011988	TCG	2	6	1237358	1237363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107141
21514	NC_011988	GA	3	6	1237388	1237393	50 %	0 %	50 %	0 %	222107141
21515	NC_011988	CCG	2	6	1237511	1237516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107142
21516	NC_011988	TTG	2	6	1237536	1237541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107142
21517	NC_011988	TGG	2	6	1237612	1237617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107142
21518	NC_011988	GCG	2	6	1237740	1237745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107142
21519	NC_011988	CAC	2	6	1237802	1237807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107142
21520	NC_011988	ATC	2	6	1237926	1237931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107142
21521	NC_011988	CGG	2	6	1237936	1237941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107142
21522	NC_011988	TCG	2	6	1237945	1237950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21523	NC_011988	AGC	2	6	1237974	1237979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21524	NC_011988	CTG	2	6	1237993	1237998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21525	NC_011988	GCC	3	9	1238000	1238008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107142
21526	NC_011988	CAC	2	6	1238033	1238038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107142
21527	NC_011988	CGG	2	6	1238044	1238049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107142
21528	NC_011988	CTG	2	6	1238090	1238095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21529	NC_011988	CAT	2	6	1238096	1238101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107142
21530	NC_011988	TTG	2	6	1238161	1238166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107142
21531	NC_011988	GCCA	2	8	1238216	1238223	25 %	0 %	25 %	50 %	222107142
21532	NC_011988	ACA	2	6	1238248	1238253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107142
21533	NC_011988	ATC	2	6	1238334	1238339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107142
21534	NC_011988	CGA	3	9	1238389	1238397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21535	NC_011988	CAA	2	6	1238422	1238427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107142
21536	NC_011988	CCG	2	6	1238467	1238472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107142
21537	NC_011988	CCA	2	6	1238596	1238601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107142
21538	NC_011988	ACG	2	6	1238622	1238627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107142
21539	NC_011988	CCAGC	2	10	1238701	1238710	20 %	0 %	20 %	60 %	222107142
21540	NC_011988	TCAA	2	8	1238736	1238743	50 %	25 %	0 %	25 %	222107142
21541	NC_011988	GGC	2	6	1239031	1239036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107143
21542	NC_011988	AAT	2	6	1239037	1239042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107143
21543	NC_011988	T	6	6	1239083	1239088	0 %	100 %	0 %	0 %	222107143
21544	NC_011988	GCC	2	6	1239092	1239097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107143
21545	NC_011988	TTCGAT	2	12	1239131	1239142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222107143
21546	NC_011988	GTG	2	6	1239153	1239158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107143
21547	NC_011988	TCG	2	6	1239231	1239236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107143
21548	NC_011988	CGA	2	6	1239322	1239327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107143
21549	NC_011988	CCA	2	6	1239337	1239342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107143
21550	NC_011988	GC	3	6	1239407	1239412	0 %	0 %	50 %	50 %	222107143
21551	NC_011988	CGG	2	6	1239605	1239610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107144
21552	NC_011988	ATC	2	6	1239693	1239698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107144
21553	NC_011988	GGCT	2	8	1239761	1239768	0 %	25 %	50 %	25 %	222107144
21554	NC_011988	TGA	2	6	1239806	1239811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107144
21555	NC_011988	CAA	2	6	1239833	1239838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107144
21556	NC_011988	ATG	2	6	1239897	1239902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107144
21557	NC_011988	CCA	2	6	1239986	1239991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107145
21558	NC_011988	CG	3	6	1240003	1240008	0 %	0 %	50 %	50 %	222107145
21559	NC_011988	TGAG	2	8	1240049	1240056	25 %	25 %	50 %	0 %	222107145
21560	NC_011988	ATC	2	6	1240081	1240086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107145
21561	NC_011988	CGC	2	6	1240112	1240117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107145
21562	NC_011988	GCGT	2	8	1240202	1240209	0 %	25 %	50 %	25 %	222107145
21563	NC_011988	ATG	2	6	1240291	1240296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107145
21564	NC_011988	CT	3	6	1240302	1240307	0 %	50 %	0 %	50 %	222107145
21565	NC_011988	GAT	2	6	1240356	1240361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107145
21566	NC_011988	GGC	2	6	1240378	1240383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107145
21567	NC_011988	GCG	3	9	1240483	1240491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107145
21568	NC_011988	GCA	2	6	1240493	1240498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107145
21569	NC_011988	ATC	2	6	1240515	1240520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107145
21570	NC_011988	GC	3	6	1240546	1240551	0 %	0 %	50 %	50 %	222107145
21571	NC_011988	ATCGCA	2	12	1240739	1240750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222107145
21572	NC_011988	ACA	2	6	1240782	1240787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107145
21573	NC_011988	CGA	2	6	1240809	1240814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107145
21574	NC_011988	CCGTGG	2	12	1240848	1240859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222107146
21575	NC_011988	GCC	2	6	1240868	1240873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107146
21576	NC_011988	CGGG	2	8	1240882	1240889	0 %	0 %	75 %	25 %	222107146
21577	NC_011988	ATG	2	6	1240917	1240922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107146
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21579	NC_011988	TGA	2	6	1240942	1240947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107146
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21582	NC_011988	GGC	2	6	1241098	1241103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107146
21583	NC_011988	TGC	2	6	1241131	1241136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107146
21584	NC_011988	ATA	2	6	1241151	1241156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107146
21585	NC_011988	TCA	2	6	1241229	1241234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107146
21586	NC_011988	ATGGC	2	10	1241250	1241259	20 %	20 %	40 %	20 %	222107146
21587	NC_011988	GC	4	8	1241399	1241406	0 %	0 %	50 %	50 %	222107146
21588	NC_011988	T	6	6	1241495	1241500	0 %	100 %	0 %	0 %	222107146
21589	NC_011988	CTGG	2	8	1241501	1241508	0 %	25 %	50 %	25 %	222107146
21590	NC_011988	GCT	2	6	1241516	1241521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107146
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21592	NC_011988	CGG	2	6	1241705	1241710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107147
21593	NC_011988	GAC	2	6	1241796	1241801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107147
21594	NC_011988	CAC	2	6	1241857	1241862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107147
21595	NC_011988	AGG	2	6	1241885	1241890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107147
21596	NC_011988	GGC	2	6	1241920	1241925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107147
21597	NC_011988	GTC	3	9	1241988	1241996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
21598	NC_011988	GAT	2	6	1242003	1242008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107147
21599	NC_011988	TGC	2	6	1242013	1242018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
21600	NC_011988	GCT	2	6	1242083	1242088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
21601	NC_011988	GCG	2	6	1242114	1242119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107147
21602	NC_011988	CGG	2	6	1242207	1242212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107147
21603	NC_011988	GAG	2	6	1242327	1242332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107147
21604	NC_011988	TGC	2	6	1242394	1242399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
21605	NC_011988	CAAGA	2	10	1242406	1242415	60 %	0 %	20 %	20 %	222107147
21606	NC_011988	TGGC	2	8	1242470	1242477	0 %	25 %	50 %	25 %	222107147
21607	NC_011988	TGC	2	6	1242526	1242531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
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21609	NC_011988	CGGT	2	8	1242700	1242707	0 %	25 %	50 %	25 %	222107147
21610	NC_011988	AGG	2	6	1242721	1242726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107147
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21613	NC_011988	TGC	2	6	1242757	1242762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107147
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21615	NC_011988	A	6	6	1243031	1243036	100 %	0 %	0 %	0 %	222107147
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21732	NC_011988	CGG	2	6	1248953	1248958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
21733	NC_011988	GGC	2	6	1249002	1249007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
21734	NC_011988	ATCT	2	8	1249093	1249100	25 %	50 %	0 %	25 %	222107153
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21743	NC_011988	GCG	2	6	1249619	1249624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107153
21744	NC_011988	CTG	2	6	1249694	1249699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
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21755	NC_011988	TGC	2	6	1250354	1250359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107153
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21764	NC_011988	TTA	2	6	1250913	1250918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107153
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21800	NC_011988	GCAT	2	8	1253047	1253054	25 %	25 %	25 %	25 %	222107155
21801	NC_011988	CTCTGG	2	12	1253342	1253353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107156
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21847	NC_011988	CGA	2	6	1255790	1255795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107158
21848	NC_011988	GTCGAT	2	12	1255824	1255835	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222107158
21849	NC_011988	TGC	2	6	1255838	1255843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107158
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21851	NC_011988	GC	3	6	1255862	1255867	0 %	0 %	50 %	50 %	222107158
21852	NC_011988	GC	3	6	1255883	1255888	0 %	0 %	50 %	50 %	222107158
21853	NC_011988	TGA	2	6	1256023	1256028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107159
21854	NC_011988	TTCAGC	2	12	1256103	1256114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222107159
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21857	NC_011988	TGCC	2	8	1256387	1256394	0 %	25 %	25 %	50 %	222107159
21858	NC_011988	GTG	2	6	1256478	1256483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107159
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21883	NC_011988	GCC	2	6	1257947	1257952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107159
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21949	NC_011988	AGT	2	6	1261523	1261528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107162
21950	NC_011988	TGGC	2	8	1261539	1261546	0 %	25 %	50 %	25 %	222107162
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21954	NC_011988	ATC	2	6	1261656	1261661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107162
21955	NC_011988	TCC	2	6	1261668	1261673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107162
21956	NC_011988	GTGATG	2	12	1261707	1261718	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222107162
21957	NC_011988	GTGC	2	8	1261776	1261783	0 %	25 %	50 %	25 %	222107162
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21960	NC_011988	CGA	2	6	1261921	1261926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107163
21961	NC_011988	CTGGCG	2	12	1261956	1261967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222107163
21962	NC_011988	AATC	2	8	1261990	1261997	50 %	25 %	0 %	25 %	222107163
21963	NC_011988	GAT	2	6	1262045	1262050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107163
21964	NC_011988	TGC	2	6	1262080	1262085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107163
21965	NC_011988	GCG	2	6	1262091	1262096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107163
21966	NC_011988	GGC	2	6	1262111	1262116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107163
21967	NC_011988	GTT	2	6	1262147	1262152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107163
21968	NC_011988	TCG	2	6	1262167	1262172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107163
21969	NC_011988	TCA	2	6	1262243	1262248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107163
21970	NC_011988	TCA	2	6	1262284	1262289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107163
21971	NC_011988	TGT	2	6	1262342	1262347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107163
21972	NC_011988	ACC	2	6	1262358	1262363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107163
21973	NC_011988	TGG	2	6	1262387	1262392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107163
21974	NC_011988	GGC	2	6	1262463	1262468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107163
21975	NC_011988	CGG	2	6	1262570	1262575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107163
21976	NC_011988	GTG	2	6	1262703	1262708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107163
21977	NC_011988	GTG	2	6	1262721	1262726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107163
21978	NC_011988	ATC	2	6	1262760	1262765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107163
21979	NC_011988	GCA	2	6	1262785	1262790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107163
21980	NC_011988	CGC	2	6	1262879	1262884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107164
21981	NC_011988	CTG	2	6	1262885	1262890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107164
21982	NC_011988	GAT	2	6	1263016	1263021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107164
21983	NC_011988	GCCTG	2	10	1263136	1263145	0 %	20 %	40 %	40 %	222107164
21984	NC_011988	TGA	2	6	1263147	1263152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107164
21985	NC_011988	TGG	2	6	1263198	1263203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107164
21986	NC_011988	TCG	2	6	1263225	1263230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107164
21987	NC_011988	TGCTG	2	10	1263394	1263403	0 %	40 %	40 %	20 %	222107164
21988	NC_011988	AAT	2	6	1263446	1263451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107164
21989	NC_011988	CTG	2	6	1263509	1263514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107164
21990	NC_011988	TGA	2	6	1263522	1263527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107164
21991	NC_011988	GCC	2	6	1263536	1263541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107164
21992	NC_011988	TGG	2	6	1263615	1263620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107164
21993	NC_011988	GCG	2	6	1263627	1263632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107164
21994	NC_011988	GCC	2	6	1263677	1263682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107164
21995	NC_011988	GGGCTG	2	12	1263707	1263718	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222107164
21996	NC_011988	CTG	3	9	1263758	1263766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107164
21997	NC_011988	ATC	2	6	1263767	1263772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107164
21998	NC_011988	TCCA	2	8	1263863	1263870	25 %	25 %	0 %	50 %	222107165
21999	NC_011988	ATG	2	6	1263899	1263904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107165
22000	NC_011988	TGG	2	6	1263920	1263925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107165

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